Naftalie était le fils du rabbin Simon Philip de Vries et de Judith de Jong, tous deux originaires de Haarlem. Il grandit à Haarlem, termina ses études secondaires et devint joueur de korfball et animateur sportif pour les jeunes. En 1929, il épousa Mirjam « Mik » Davida Roos ; ils eurent deux fils. Après avoir vécu dans plusieurs villes néerlandaises, la famille s'installa à Haarlem en 1939 et, en mars 1941, elle était enregistrée au 142r Wagenweg en tant que sous-locataires.
En août 1942, Naftalie ignore un ordre de déportation et la famille se cache à Nieuwkoop. Ils sont trahis ; lorsque la police arrive le 7 avril 1943, Naftalie se rend pour protéger les autres et est arrêté avec sa femme et ses enfants. Ils sont emmenés à Amsterdam, puis internés à Westerbork. En janvier 1944, la famille fut déportée à Bergen-Belsen. Le 11 avril 1945, alors qu'ils étaient transférés vers Theresienstadt dans le cadre d'un transport forcé, Naftalie mourut de faim et d'épuisement près de Lüneburg, à l'âge de 42 ans. Il fut ensuite réinhumé à Haarlem.